HEADER ANTIFREEZE PROTEINS 29-OCT-91 1ATF 1ATF 2 COMPND ANTIFREEZE POLYPEPTIDE (APF) (THEORETICAL MODEL) 1ATFA 1 SOURCE WINTER FLOUNDER (PSEUDOPLEURONECTES $AMERICANUS) 1ATF 4 EXPDTA THEORETICAL MODEL 1ATF 5 AUTHOR K.-*C.CHOU 1ATF 6 REVDAT 2 15-OCT-94 1ATFA 1 COMPND 1ATFA 2 REVDAT 1 15-JAN-92 1ATF 0 1ATF 7 JRNL AUTH K.-*C.CHOU 1ATF 8 JRNL TITL ENERGY-OPTIMIZED STRUCTURE OF ANTIFREEZE PROTEIN 1ATF 9 JRNL TITL 2 AND ITS BINDING MECHANISM 1ATF 10 JRNL REF J.MOL.BIOL. V. 223 509 1992 1ATF 11 JRNL REFN ASTM JMOBAK UK ISSN 0022-2836 070 1ATF 12 REMARK 1 1ATF 13 REMARK 1 REFERENCE 1 1ATF 14 REMARK 1 AUTH C.A.KNIGHT,C.C.CHENG,A.L.DE*VRIES 1ATF 15 REMARK 1 TITL ADSORPTION OF ALPHA-HELICAL ANTIFREEZE PEPTIDES ON 1ATF 16 REMARK 1 TITL 2 SPECIFIC ICE CRYSTAL SURFACE PLANES 1ATF 17 REMARK 1 REF BIOPHYS.J. V. 59 409 1991 1ATF 18 REMARK 1 REFN ASTM BIOJAU US ISSN 0006-3495 030 1ATF 19 REMARK 1 REFERENCE 2 1ATF 20 REMARK 1 AUTH D.S.C.YANG,M.SAX,A.CHAKRABARTTY,C.L.HEW 1ATF 21 REMARK 1 TITL CRYSTAL STRUCTURE OF AN ANTIFREEZE POLYPEPTIDE 1ATF 22 REMARK 1 TITL 2 AND ITS MECHANISTIC IMPLICATIONS 1ATF 23 REMARK 1 REF NATURE V. 333 232 1988 1ATF 24 REMARK 1 REFN ASTM NATUAS UK ISSN 0028-0836 006 1ATF 25 REMARK 2 1ATF 26 REMARK 2 RESOLUTION. NOT APPLICABLE. SEE REMARK 4. 1ATF 27 REMARK 3 1ATF 28 REMARK 3 REFINEMENT. NOT APPLICABLE. SEE REMARK 4. 1ATF 29 REMARK 4 1ATF 30 REMARK 4 THE COORDINATES IN THIS ENTRY REPRESENT A MODEL STRUCTURE. 1ATF 31 REMARK 4 THE QUANTITIES PRESENTED ON THE *CRYST1* AND *SCALE* 1ATF 32 REMARK 4 RECORDS BELOW ARE DUMMY VALUES. 1ATF 33 REMARK 5 1ATFA 3 REMARK 5 CORRECTION. MODIFY COMPND RECORD TO INDICATE THEORETICAL 1ATFA 4 REMARK 5 MODEL. 15-OCT-94. 1ATFA 5 SEQRES 1 37 ASP THR ALA SER ASP ALA ALA ALA ALA ALA ALA LEU THR 1ATF 34 SEQRES 2 37 ALA ALA ASN ALA LYS ALA ALA ALA GLU LEU THR ALA ALA 1ATF 35 SEQRES 3 37 ASN ALA ALA ALA ALA ALA ALA ALA THR ALA ARG 1ATF 36 HELIX 1 H ASP 1 ARG 37 1 SINGLE ALPHA HELIX 1ATF 37 CRYST1 1.000 1.000 1.000 90.00 90.00 90.00 P 1 1 1ATF 38 ORIGX1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 1ATF 39 ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 1ATF 40 ORIGX3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 1ATF 41 SCALE1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 1ATF 42 SCALE2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 1ATF 43 SCALE3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 1ATF 44 ATOM 1 N ASP 1 0.364 -1.967 -26.506 1.00 7.00 1ATF 45 ATOM 2 CA ASP 1 1.440 -1.343 -25.754 1.00 7.00 1ATF 46 ATOM 3 C ASP 1 0.861 -0.245 -24.860 1.00 7.00 1ATF 47 ATOM 4 O ASP 1 1.333 -0.034 -23.744 1.00 7.00 1ATF 48 ATOM 5 CB ASP 1 2.465 -0.700 -26.689 1.00 7.00 1ATF 49 ATOM 6 CG ASP 1 1.906 0.382 -27.616 1.00 7.00 1ATF 50 ATOM 7 OD1 ASP 1 0.815 0.234 -28.185 1.00 7.00 1ATF 51 ATOM 8 OD2 ASP 1 2.651 1.428 -27.744 1.00 7.00 1ATF 52 ATOM 9 1H ASP 1 0.162 -1.467 -27.365 1.00 7.00 1ATF 53 ATOM 10 2H ASP 1 -0.499 -2.002 -25.976 1.00 7.00 1ATF 54 ATOM 11 HA ASP 1 1.894 -2.151 -25.180 1.00 7.00 1ATF 55 ATOM 12 1HB ASP 1 3.262 -0.264 -26.086 1.00 7.00 1ATF 56 ATOM 13 2HB ASP 1 2.918 -1.481 -27.300 1.00 7.00 1ATF 57 ATOM 14 HD2 ASP 1 2.223 2.077 -28.373 1.00 7.00 1ATF 58 ATOM 15 N THR 2 -0.154 0.427 -25.384 1.00 7.00 1ATF 59 ATOM 16 CA THR 2 -0.784 1.518 -24.659 1.00 7.00 1ATF 60 ATOM 17 C THR 2 -1.612 0.975 -23.493 1.00 7.00 1ATF 61 ATOM 18 O THR 2 -1.850 1.682 -22.514 1.00 7.00 1ATF 62 ATOM 19 CB THR 2 -1.604 2.337 -25.658 1.00 7.00 1ATF 63 ATOM 20 OG1 THR 2 -2.176 1.359 -26.522 1.00 7.00 1ATF 64 ATOM 21 CG2 THR 2 -0.726 3.183 -26.582 1.00 7.00 1ATF 65 ATOM 22 H THR 2 -0.545 0.237 -26.285 1.00 7.00 1ATF 66 ATOM 23 HA THR 2 0.000 2.143 -24.232 1.00 7.00 1ATF 67 ATOM 24 HB THR 2 -2.338 2.957 -25.142 1.00 7.00 1ATF 68 ATOM 25 HG1 THR 2 -2.919 1.766 -27.054 1.00 7.00 1ATF 69 ATOM 26 1HG2 THR 2 -0.124 3.868 -25.984 1.00 7.00 1ATF 70 ATOM 27 2HG2 THR 2 -0.070 2.531 -27.158 1.00 7.00 1ATF 71 ATOM 28 3HG2 THR 2 -1.359 3.754 -27.262 1.00 7.00 1ATF 72 ATOM 29 N ALA 3 -2.028 -0.275 -23.635 1.00 7.00 1ATF 73 ATOM 30 CA ALA 3 -2.790 -0.933 -22.588 1.00 7.00 1ATF 74 ATOM 31 C ALA 3 -1.830 -1.454 -21.515 1.00 7.00 1ATF 75 ATOM 32 O ALA 3 -2.121 -1.369 -20.323 1.00 7.00 1ATF 76 ATOM 33 CB ALA 3 -3.640 -2.048 -23.199 1.00 7.00 1ATF 77 ATOM 34 H ALA 3 -1.853 -0.833 -24.446 1.00 7.00 1ATF 78 ATOM 35 HA ALA 3 -3.452 -0.191 -22.142 1.00 7.00 1ATF 79 ATOM 36 1HB ALA 3 -4.303 -1.627 -23.956 1.00 7.00 1ATF 80 ATOM 37 2HB ALA 3 -2.989 -2.791 -23.660 1.00 7.00 1ATF 81 ATOM 38 3HB ALA 3 -4.236 -2.521 -22.418 1.00 7.00 1ATF 82 ATOM 39 N SER 4 -0.706 -1.981 -21.978 1.00 7.00 1ATF 83 ATOM 40 CA SER 4 0.172 -2.749 -21.112 1.00 7.00 1ATF 84 ATOM 41 C SER 4 0.836 -1.825 -20.088 1.00 7.00 1ATF 85 ATOM 42 O SER 4 0.859 -2.129 -18.897 1.00 7.00 1ATF 86 ATOM 43 CB SER 4 1.234 -3.492 -21.924 1.00 7.00 1ATF 87 ATOM 44 OG SER 4 2.088 -2.597 -22.632 1.00 7.00 1ATF 88 ATOM 45 H SER 4 -0.394 -1.890 -22.923 1.00 7.00 1ATF 89 ATOM 46 HA SER 4 -0.474 -3.471 -20.613 1.00 7.00 1ATF 90 ATOM 47 1HB SER 4 1.833 -4.112 -21.257 1.00 7.00 1ATF 91 ATOM 48 2HB SER 4 0.746 -4.164 -22.631 1.00 7.00 1ATF 92 ATOM 49 HG SER 4 2.855 -3.100 -23.030 1.00 7.00 1ATF 93 ATOM 50 N ASP 5 1.360 -0.717 -20.591 1.00 7.00 1ATF 94 ATOM 51 CA ASP 5 2.119 0.198 -19.756 1.00 7.00 1ATF 95 ATOM 52 C ASP 5 1.169 0.901 -18.784 1.00 7.00 1ATF 96 ATOM 53 O ASP 5 1.555 1.233 -17.664 1.00 7.00 1ATF 97 ATOM 54 CB ASP 5 2.811 1.269 -20.600 1.00 7.00 1ATF 98 ATOM 55 CG ASP 5 1.868 2.229 -21.327 1.00 7.00 1ATF 99 ATOM 56 OD1 ASP 5 0.782 1.837 -21.781 1.00 7.00 1ATF 100 ATOM 57 OD2 ASP 5 2.292 3.444 -21.421 1.00 7.00 1ATF 101 ATOM 58 H ASP 5 1.273 -0.442 -21.549 1.00 7.00 1ATF 102 ATOM 59 HA ASP 5 2.854 -0.424 -19.244 1.00 7.00 1ATF 103 ATOM 60 1HB ASP 5 3.470 1.850 -19.954 1.00 7.00 1ATF 104 ATOM 61 2HB ASP 5 3.444 0.776 -21.339 1.00 7.00 1ATF 105 ATOM 62 HD2 ASP 5 1.615 4.007 -21.894 1.00 7.00 1ATF 106 ATOM 63 N ALA 6 -0.054 1.109 -19.249 1.00 7.00 1ATF 107 ATOM 64 CA ALA 6 -1.066 1.755 -18.430 1.00 7.00 1ATF 108 ATOM 65 C ALA 6 -1.477 0.812 -17.297 1.00 7.00 1ATF 109 ATOM 66 O ALA 6 -1.647 1.242 -16.158 1.00 7.00 1ATF 110 ATOM 67 CB ALA 6 -2.251 2.162 -19.309 1.00 7.00 1ATF 111 ATOM 68 H ALA 6 -0.357 0.845 -20.165 1.00 7.00 1ATF 112 ATOM 69 HA ALA 6 -0.622 2.653 -18.001 1.00 7.00 1ATF 113 ATOM 70 1HB ALA 6 -1.910 2.850 -20.082 1.00 7.00 1ATF 114 ATOM 71 2HB ALA 6 -2.678 1.274 -19.775 1.00 7.00 1ATF 115 ATOM 72 3HB ALA 6 -3.007 2.650 -18.695 1.00 7.00 1ATF 116 ATOM 73 N ALA 7 -1.625 -0.456 -17.650 1.00 7.00 1ATF 117 ATOM 74 CA ALA 7 -2.012 -1.464 -16.677 1.00 7.00 1ATF 118 ATOM 75 C ALA 7 -0.889 -1.635 -15.652 1.00 7.00 1ATF 119 ATOM 76 O ALA 7 -1.151 -1.795 -14.461 1.00 7.00 1ATF 120 ATOM 77 CB ALA 7 -2.345 -2.770 -17.400 1.00 7.00 1ATF 121 ATOM 78 H ALA 7 -1.485 -0.798 -18.580 1.00 7.00 1ATF 122 ATOM 79 HA ALA 7 -2.907 -1.106 -16.168 1.00 7.00 1ATF 123 ATOM 80 1HB ALA 7 -3.165 -2.600 -18.099 1.00 7.00 1ATF 124 ATOM 81 2HB ALA 7 -1.468 -3.118 -17.946 1.00 7.00 1ATF 125 ATOM 82 3HB ALA 7 -2.641 -3.524 -16.670 1.00 7.00 1ATF 126 ATOM 83 N ALA 8 0.337 -1.595 -16.152 1.00 7.00 1ATF 127 ATOM 84 CA ALA 8 1.500 -1.759 -15.297 1.00 7.00 1ATF 128 ATOM 85 C ALA 8 1.589 -0.575 -14.332 1.00 7.00 1ATF 129 ATOM 86 O ALA 8 1.871 -0.754 -13.149 1.00 7.00 1ATF 130 ATOM 87 CB ALA 8 2.754 -1.902 -16.162 1.00 7.00 1ATF 131 ATOM 88 H ALA 8 0.541 -1.453 -17.121 1.00 7.00 1ATF 132 ATOM 89 HA ALA 8 1.363 -2.675 -14.723 1.00 7.00 1ATF 133 ATOM 90 1HB ALA 8 2.642 -2.759 -16.825 1.00 7.00 1ATF 134 ATOM 91 2HB ALA 8 2.890 -0.998 -16.757 1.00 7.00 1ATF 135 ATOM 92 3HB ALA 8 3.623 -2.049 -15.521 1.00 7.00 1ATF 136 ATOM 93 N ALA 9 1.344 0.609 -14.874 1.00 7.00 1ATF 137 ATOM 94 CA ALA 9 1.409 1.824 -14.080 1.00 7.00 1ATF 138 ATOM 95 C ALA 9 0.325 1.782 -13.001 1.00 7.00 1ATF 139 ATOM 96 O ALA 9 0.579 2.127 -11.848 1.00 7.00 1ATF 140 ATOM 97 CB ALA 9 1.272 3.042 -14.996 1.00 7.00 1ATF 141 ATOM 98 H ALA 9 1.104 0.745 -15.836 1.00 7.00 1ATF 142 ATOM 99 HA ALA 9 2.387 1.855 -13.600 1.00 7.00 1ATF 143 ATOM 100 1HB ALA 9 0.316 2.996 -15.520 1.00 7.00 1ATF 144 ATOM 101 2HB ALA 9 1.316 3.952 -14.399 1.00 7.00 1ATF 145 ATOM 102 3HB ALA 9 2.084 3.043 -15.723 1.00 7.00 1ATF 146 ATOM 103 N ALA 10 -0.859 1.355 -13.413 1.00 7.00 1ATF 147 ATOM 104 CA ALA 10 -1.990 1.292 -12.503 1.00 7.00 1ATF 148 ATOM 105 C ALA 10 -1.684 0.294 -11.385 1.00 7.00 1ATF 149 ATOM 106 O ALA 10 -1.967 0.558 -10.217 1.00 7.00 1ATF 150 ATOM 107 CB ALA 10 -3.254 0.924 -13.284 1.00 7.00 1ATF 151 ATOM 108 H ALA 10 -1.052 1.057 -14.348 1.00 7.00 1ATF 152 ATOM 109 HA ALA 10 -2.122 2.283 -12.069 1.00 7.00 1ATF 153 ATOM 110 1HB ALA 10 -3.438 1.674 -14.052 1.00 7.00 1ATF 154 ATOM 111 2HB ALA 10 -3.120 -0.051 -13.753 1.00 7.00 1ATF 155 ATOM 112 3HB ALA 10 -4.104 0.886 -12.602 1.00 7.00 1ATF 156 ATOM 113 N ALA 11 -1.110 -0.833 -11.781 1.00 7.00 1ATF 157 ATOM 114 CA ALA 11 -0.807 -1.892 -10.834 1.00 7.00 1ATF 158 ATOM 115 C ALA 11 0.269 -1.406 -9.860 1.00 7.00 1ATF 159 ATOM 116 O ALA 11 0.231 -1.732 -8.674 1.00 7.00 1ATF 160 ATOM 117 CB ALA 11 -0.381 -3.150 -11.593 1.00 7.00 1ATF 161 ATOM 118 H ALA 11 -0.854 -1.027 -12.728 1.00 7.00 1ATF 162 ATOM 119 HA ALA 11 -1.718 -2.109 -10.276 1.00 7.00 1ATF 163 ATOM 120 1HB ALA 11 -1.187 -3.464 -12.256 1.00 7.00 1ATF 164 ATOM 121 2HB ALA 11 0.511 -2.935 -12.181 1.00 7.00 1ATF 165 ATOM 122 3HB ALA 11 -0.165 -3.947 -10.882 1.00 7.00 1ATF 166 ATOM 123 N LEU 12 1.203 -0.635 -10.397 1.00 7.00 1ATF 167 ATOM 124 CA LEU 12 2.301 -0.122 -9.596 1.00 7.00 1ATF 168 ATOM 125 C LEU 12 1.744 0.785 -8.496 1.00 7.00 1ATF 169 ATOM 126 O LEU 12 2.097 0.637 -7.327 1.00 7.00 1ATF 170 ATOM 127 CB LEU 12 3.341 0.560 -10.486 1.00 7.00 1ATF 171 ATOM 128 CG LEU 12 4.491 1.261 -9.759 1.00 7.00 1ATF 172 ATOM 129 CD1 LEU 12 5.299 0.266 -8.924 1.00 7.00 1ATF 173 ATOM 130 CD2 LEU 12 5.373 2.032 -10.744 1.00 7.00 1ATF 174 ATOM 131 H LEU 12 1.218 -0.362 -11.359 1.00 7.00 1ATF 175 ATOM 132 HA LEU 12 2.789 -0.975 -9.125 1.00 7.00 1ATF 176 ATOM 133 1HB LEU 12 3.764 -0.189 -11.156 1.00 7.00 1ATF 177 ATOM 134 2HB LEU 12 2.831 1.294 -11.110 1.00 7.00 1ATF 178 ATOM 135 HG LEU 12 4.065 1.990 -9.070 1.00 7.00 1ATF 179 ATOM 136 1HD1 LEU 12 5.609 -0.568 -9.553 1.00 7.00 1ATF 180 ATOM 137 2HD1 LEU 12 6.180 0.764 -8.518 1.00 7.00 1ATF 181 ATOM 138 3HD1 LEU 12 4.682 -0.105 -8.105 1.00 7.00 1ATF 182 ATOM 139 1HD2 LEU 12 4.769 2.771 -11.270 1.00 7.00 1ATF 183 ATOM 140 2HD2 LEU 12 6.170 2.537 -10.198 1.00 7.00 1ATF 184 ATOM 141 3HD2 LEU 12 5.807 1.338 -11.463 1.00 7.00 1ATF 185 ATOM 142 N THR 13 0.882 1.702 -8.910 1.00 7.00 1ATF 186 ATOM 143 CA THR 13 0.321 2.673 -7.985 1.00 7.00 1ATF 187 ATOM 144 C THR 13 -0.576 1.976 -6.961 1.00 7.00 1ATF 188 ATOM 145 O THR 13 -0.642 2.389 -5.804 1.00 7.00 1ATF 189 ATOM 146 CB 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ATOM 424 H ALA 36 -1.340 -0.854 23.788 1.00 7.00 1ATF 467 ATOM 425 HA ALA 36 -3.134 -1.238 25.944 1.00 7.00 1ATF 468 ATOM 426 1HB ALA 36 -3.512 -2.118 23.673 1.00 7.00 1ATF 469 ATOM 427 2HB ALA 36 -2.073 -3.154 23.827 1.00 7.00 1ATF 470 ATOM 428 3HB ALA 36 -3.488 -3.437 24.868 1.00 7.00 1ATF 471 ATOM 429 N ARG 37 -0.161 -2.609 26.045 1.00 7.00 1ATF 472 ATOM 430 CA ARG 37 0.813 -3.232 26.925 1.00 7.00 1ATF 473 ATOM 431 C ARG 37 1.219 -2.264 28.038 1.00 7.00 1ATF 474 ATOM 432 O ARG 37 1.525 -2.686 29.152 1.00 7.00 1ATF 475 ATOM 433 CB ARG 37 2.061 -3.661 26.151 1.00 7.00 1ATF 476 ATOM 434 CG ARG 37 1.756 -4.845 25.231 1.00 7.00 1ATF 477 ATOM 435 CD ARG 37 1.872 -6.170 25.987 1.00 7.00 1ATF 478 ATOM 436 NE ARG 37 1.503 -7.294 25.097 1.00 7.00 1ATF 479 ATOM 437 CZ ARG 37 2.343 -7.860 24.205 1.00 7.00 1ATF 480 ATOM 438 NH1 ARG 37 3.576 -7.400 24.106 1.00 7.00 1ATF 481 ATOM 439 NH2 ARG 37 1.928 -8.881 23.426 1.00 7.00 1ATF 482 ATOM 440 OXT ARG 37 1.209 -1.017 27.706 1.00 7.00 1ATF 483 ATOM 441 H ARG 37 0.193 -2.334 25.151 1.00 7.00 1ATF 484 ATOM 442 HA ARG 37 0.302 -4.105 27.332 1.00 7.00 1ATF 485 ATOM 443 1HB ARG 37 2.432 -2.823 25.560 1.00 7.00 1ATF 486 ATOM 444 2HB ARG 37 2.851 -3.933 26.850 1.00 7.00 1ATF 487 ATOM 445 1HG ARG 37 0.751 -4.743 24.821 1.00 7.00 1ATF 488 ATOM 446 2HG ARG 37 2.446 -4.842 24.387 1.00 7.00 1ATF 489 ATOM 447 1HD ARG 37 2.891 -6.303 26.351 1.00 7.00 1ATF 490 ATOM 448 2HD ARG 37 1.220 -6.158 26.861 1.00 7.00 1ATF 491 ATOM 449 HE ARG 37 0.573 -7.657 25.162 1.00 7.00 1ATF 492 ATOM 450 1HH1 ARG 37 4.259 -7.762 23.471 1.00 7.00 1ATF 493 ATOM 451 1HH2 ARG 37 2.556 -9.295 22.767 1.00 7.00 1ATF 494 ATOM 452 2HH2 ARG 37 0.992 -9.224 23.507 1.00 7.00 1ATF 495 ATOM 453 HXT ARG 37 1.471 -0.453 28.489 1.00 7.00 1ATF 496 TER 454 ARG 37 1ATF 497 MASTER 24 0 0 1 0 0 0 6 452 1 0 3 1ATFA 6 END 1ATF 499